Учреждение «Клиника Международного казахско-турецкого университета им. Х.А. Ясави» реорганизовано из городской клинической больницы МСЧ «Фосфор» на основании решения акима г. Шымкента. Учреждение образовано на праве оперативного управления и находится под юрисдикцией МКТУ им. Х.А. Ясави. В 2008 г. высокую оценку уровню подготовки специалистов медицинского факультета на базе этой клиники дал Президент РК Нурсултан Назарбаев, передав специальность «Лечебное дело» и около 2 тысяч студентов из ЮКГМА в МКТУ.

Основным назначением деятельности клиники является оказание высококвалифицированной специализированной лечебно-диагностической, консультативной помощи прикреплённому населению, создание условий для теоретических и практических занятий студентов старших курсов медицинского факультета.

Клиника является одной из крупных медицинских организаций города. Структура клиники: поликлиника, родильный дом, терапевтический и хирургический стационары на 260 коек.
Поликлиника МКТУ им. Х.А. Ясави обслуживает район с населением 55 917 человек, ведётся прием по 23 специальностям, работают 3 социальных работника и врач-психолог. Плановая мощность поликлиники – 500 посещений взрослых и 200 детей в смену. Есть дневной стационар на 10 коек. К поликлинике с января 2014 г. прикреплены ещё 6846 детей.

На территории клиники расположен Южно-Казахстанский филиал НЦГТ и ПЗ МЗСР РК с профпатологическим отделением на 20 коек, где лечатся профбольные фосфорного, свинцового и цементного заводов и др. В составе клиники – приёмное отделение, клинико-диагностическая лаборатория, в том числе две экспресс-лаборатории, баклаборатория, отделение лучевых и физических методов диагностики, внутрибольничная аптека, отделение физиотерапии.

Служба родовспоможения представлена акушерско-гинекологическим отделением в поликлинике, отделением гинекологии и родильным домом. Ежегодно на свет в роддоме появляются около 3500 новорождённых. Случаев материнской и младенческой смертности за последние 3 года не зарегистрировано. В клинике 975 сотрудников, в том числе 175 врачей, 2 д.м.н., 2 члена-корреспонта Российской академии естествознания, 9 к.м.н., 73,6% врачей имеют квалификационные категории, 470 медицинских сестёр, 199 человек младшего медицинского персонала, 131 работник службы АХЧ. Среди них известные врачи в области и республике, 15 отличников здравоохранения РК. На базе клиники расположено 6 клинических кафедр университета – терапии, общей врачебной практики, хирургии, акушерства, гинекологии и педиатрии, инфекционных болезней и фтизиатрии, клинической морфологии, фармакологии и внутренних болезней. С 2009 по 2014 г. на базе клиники МКТУ прошли обучение 3556 студентов и 3136 врачей-интернов.

Наличие высококвалифицированных, преданных своему делу врачей и работников среднего медицинского звена, освоение перспективных лечебно-диагностических технологий, обновление и расширение материально-технической базы – всё это обеспечивает не только положительную динамику показателей работы, но и возможность дальнейшего развития первичного звена и клиники в целом.